Diferentemente do que informam os genealogistas Pedro Taques e Silva Leme, João do Prado não nasceu em Olivença, Alentejo, Portugal, sendo descendente de família nobre, e não veio para o Brasil em 1530, na armada de Martim Afonso de Sousa. Possivelmente, fosse até mesmo nascido no Brasil. Ele realizou muitas entradas pelo sertão à procura de índios. Foi cidadão de grande relevo em São Paulo, onde exerceu diversos cargos na Câmara, inclusive o de juiz ordinário no período de 1588 a 1592. Faleceu quando acompanhava o Capitão-Mor João Pereira de Souza em entrada que buscava minerais na Serra Sabarabuçu (hoje, a cidade de Sabará-MG). Não se conhece a ascendência de João do Prado.