Em 1600, depois do falecimento de seu pai, requereu ao Governador Geral do Estado, D. Francisco de Sousa, que lhe fossem guardados e cumpridos os privilégios, honras e liberdades que lhe competiam pelos instrumentos de seu defunto pai, o que foi deferido numa provisão passada pelo dito governador, reconhecida pelos tabeliães de São Paulo, Santos e São Vicente nesse mesmo ano. Além dos filhos que teve com sua esposa Leonor, Pedro foi pai de mais 2 filhos naturais.